Моделирование процессов взаимодействия диоксинов со структурными элементами клеточной мембраны - 4 Рис. 1 Таблица Адсорбционные комплексы в системе тетрахлорбифенил - липид
Учебные материалы


Моделирование процессов взаимодействия диоксинов со структурными элементами клеточной мембраны - 4




Молекулярный граф молекулы 2,3,7,8-тетрахлордибензофурана представлен на рис. 11.

Рис. 11.

Молекулярный граф 2,3,7,8-тетрахлордибензофурана
Были получены наиболее вероятные оптимизированные структуры адсорбционных комплексов 3,3/,4,4/-тетрахлорбифенила со структурными компонентами клеточной мембраны., геометрические и энергетические характеристики которых представлены в табл. 5.

Таблица 5.

Значения длин связей и энергии в адсорбционных комплексах 3,3/,4,4/-тетрахлорбифенил – компонент мембраны по результатам РМ3-расчета в программном комплексе МОРАС

АК
Атомы
Длина связи, Å
Eel,
эВ
Erep,
эВ
ΔH0f,
кДж/моль

Адсорбционные комплексы в системе тетрахлорбифенил - трипептид



1
Cl3 …H10
2,426
-49188,509
42936,604
-5,017

2
Cl3 …H14
2,347
-49021,346
42769,486
-0,675

3
Cl4 …H10
1,861
-49247,599
42995,689
-5,500

4
Cl4 …H21
2,004
-51601,146
45349,239
-5,210

5
Cl4 …H30
2,335
-52030,110
45778,207
-4,824

Адсорбционные комплексы в системе тетрахлорбифенил - липид



1
Cl3 …H77
2,470
-174650,958
161678,599
-25,376

2
Cl3 …H79
2,611
-181379,295
168406,711
-47,085

3
Cl4 …H77
2,603
-172523,112
159550,911
-10,131

4
Cl4 …H78
2,623
-172401,474
159429,197
-17,464

Адсорбционные комплексы в системе тетрахлорбифенил - кефалин



1
Cl3 …H138
2,124
-144975,628
133460,634
-1,833

2
Cl4 …H138
2,506
-148679,835
137164,804
-5,403

Адсорбционные комплексы в системе тетрахлорбифенил - трегалоза



1
Cl3 …H52
2,158
-70413,177
62640,107
-5,982

2
Cl3 …H51
2,483
-68709,638
60936,149
-46,409

3
Cl3 …H50
2,114
-72214,773
64441,667
-9,456

4
Cl4 …H55
2,357
-67275,262
59501,578
-65,224

5
Cl4 …H52
2,458
-69065,921
61292,031
-85,100

6
Cl4 …H50
2,296
-70731,591
62958,031
-52,260

Полученные в результате активные центры поверхности 3,3/,4,4/-тетрахлорбифенила отображены на молекулярном графе (рис. 12).

Рис. 12.

Молекулярный граф 3,3/,4,4/-тетрахлорбифенила
Для 2,4-дихлорфенола также были получены адсорбционные комплексы и рассчитаны их характеристики (табл. 6).

Таблица 6.

Значения длин связей и энергии в адсорбционных комплексах взаимодействия дихлорфенол – компонент мембраны по результатам РМ3-расчета в программном комплексе МОРАС

АК
Атомы
Длина связи, Å
Eel,
эВ
Erep,
эВ
ΔH0f,
кДж/моль

Адсорбционные комплексы в системе дихлорфенол - трипептид



1
Н1 …О4
1,808
-40293,872
35122,872
-22,561

2
Н1 …О15
1,814
-39593,982
34422,995
-21,369

3
O1 …H7
1,848
-39940,198
34769,246
-17,994

4
O1 …H8
1,861
-39854,576
34683,750
-5,767

5
O1 …H10
1,809
-37679,693
32508,702
-21,741

6
O1 …H12
1,846
-40090,506
34919,591
-14,384

7
O1 …H13
1,838
-40069,793
34898,840
-18,038

Адсорбционные комплексы в системе дихлорфенол - липид



1
Н1 …О28
1,818
-154725,635
142834,073
-23,359

2
O1 …H77
1,799
-155142,724
143251,619
-9,251

3
Cl2 …H78
1,987
-154879,503
142988,338
-14,982

4
Cl4 …H77
1,848
-155088,146
143197,021
-11,151

Адсорбционные комплексы в системе дихлорфенол - кефалин



1
Н1 …О19
1,799
-120645,846
110211,683
-26,514

2
Н1 …О62
1,849
-125566,917
115132,891
-13,365

Адсорбционные комплексы в системе дихлорфенол - трегалоза



1
Н1 …О7
1,837
-57121,551
50429,210
-40,564

2
Н1 …О8
1,850
-55917,824
49225,599
-29,369

3
Н1 …О16
1,821
-56655,192
49963,050
-21,315

4
Н1 …О17
1,828
-55740,362
49048,140
-29,044

5
Н1 …О18
1,895
-58946,943
52254,652
-35,688

6
Н1 …О20
1,813
-56535,461
49843,202
-32,597

7
Н1 …О21
1,810
-55999,259
49306,864
-45,703

8
Н1 …О23
1,816
-56013,921
49321,644
-34,316

9
O1 …H31
1,839
-58098,342
51406,202
-21,115

10
O1 …H56
1,846
-58425,703
51733,430
-33,915

11
Cl4 …H50
1,921
-55756,440
49064,379
-13,459

Последнее изменение этой страницы: 2018-09-09;


dommodels.ru 2018 год. Все права принадлежат их авторам! Главная